盐酸小檗碱（也称黄连素），是许多药用植物天然生成的异喹啉生物碱，具有抗多种微生物感染包括犬小孢子菌（Microsporum canis）的活性作用。然而，这其中潜在的机制却知之甚少。为此，浙江农业科学院畜牧兽医研究所鲍国连所长领衔的课题组对小檗碱抗M. canis感染的作用机制进行了深入研究。研究人员采用数字基因表达谱（DGE）测序对小檗碱处理的M. canis转录组进行分析。高通量测序分别从小檗碱或对照DMSO处理的M. canis中获取了8476945，14256722，7708575，5669955，6565513和9303468条tags。总共比对到8,783个基因，其中1,890个基因在两组之间发生显著差异表达。这其中，小檗碱处理组相比于对照组，有1,030个基因表达上调，860个基因表达下调（P＜0.05）。此外，GO富集分析鉴定出23个GO项，如钙转运ATP酶活性，2-氧化戊二酸代谢过程，缬氨酸代谢过程，过氧化物酶体，和未折叠蛋白结合。通路富集性分析鉴定出6个显著信号通路，包括类固醇生物合成，类固醇激素合成，帕金森病，2,4-二氯苯甲酸降解，和托品烷，**和异喹啉生物碱的生物合成。11个选定的差异表达基因得到了实时定量PCR的验证。上述研究全面考察了M. canis在小檗碱处理下的基因表达谱，并揭示出小檗碱对M. canis的复杂作用机制。
本研究中DGE测序项目由联川生物承担完成。
参考文章：
Xiao C-W, Ji Q-A, Wei Q, Liu Y, Pan L-J, Bao G-L. (2015) Digital Gene Expression Analysis of Microsporum canisExposed to Berberine Chloride. PLoS ONE 10(4): e0124265. doi:10.1371/journal. pone.0124265.
获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打800-857-1452。